基于多尺度卷積塊U-Net的免疫熒光圖像表皮自動分割方法及其在小纖維神經病變研究中的應用

《Biomedical Signal Processing and Control》:Multiscale convolution block U-Net for automatic epidermis segmentation in immunofluorescence images

【字體: 時間:2025年05月22日 來源:Biomedical Signal Processing and Control 4.9

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  推薦:針對高分辨率免疫熒光圖像中表皮區域分割的難題,研究人員開發了基于多尺度卷積塊U-Net(McBU-Net)的自動分割框架。通過圖像分區、多尺度特征融合和密集跳躍連接,模型在內部數據集上達到92.80%的Dice分數,為小纖維神經病變(SFN)的神經纖維密度(IENFd)分析提供了高效工具。

  

論文解讀

在神經病理學領域,小纖維神經病變(Small Fiber Neuropathy, SFN)是一種令人痛苦的疾病,其特征是皮膚外周神經纖維的減少和退化,常見于20-50%的糖尿。―M)、HIV/AIDS和化療患者。診斷SFN的金標準之一是表皮內神經纖維密度(Intraepidermal Nerve Fiber Density, IENFd)檢測,而免疫熒光顯微鏡技術因其高分辨率(1-5 μm)成為揭示神經纖維結構的首選方法。然而,現有表皮分割主要依賴人工閾值處理,效率低且主觀性強,亟需自動化解決方案。

為此,臺灣大學醫院的研究團隊在《Biomedical Signal Processing and Control》發表論文,提出了一種創新的多尺度卷積塊U-Net(McBU-Net)模型。該研究通過分區處理超高分辨率圖像,結合多尺度特征學習和密集跳躍連接,顯著提升了分割精度。

關鍵技術方法

  1. 圖像分區:將原始圖像分割為可處理的子圖以保留細節;
  2. 多尺度卷積塊:采用雙卷積管道(3×3和5×5核)提取不同尺度特征;
  3. U型架構:五層編碼器-解碼器結構,通過跳躍連接增強特征傳遞;
  4. 交叉驗證:基于內部皮膚活檢數據集(PGP 9.5/NKCC1標記)進行五折驗證。

研究結果

1. 模型架構優勢
McBU-Net通過多尺度卷積塊捕獲表皮邊界的細微差異,實驗顯示其Dice分數(92.80%)超越7種對比模型(如傳統U-Net和FCN),尤其擅長處理光照不均的復雜結構。

2. 圖像分區策略
分區處理使模型能適應超高分辨率(單圖約20000×20000像素),重建后邊界連續性優于直接下采樣方法。

3. 消融實驗
移除多尺度塊或跳躍連接會導致Dice下降3-5%,證實其關鍵作用。

討論與意義
該研究首次將U-Net變體應用于免疫熒光表皮分割,解決了傳統方法在組織異質性(如汗腺干擾)下的局限性。臨床層面,自動化IENFd分析可加速SFN診斷,尤其適用于糖尿病相關神經病變的早期篩查。未來方向包括擴展至其他標記物(如Na+-K+-Cl-共轉運體1)和多中心驗證。

結論
McBU-Net為SFN研究提供了可靠的計算機輔助工具,其創新設計(多尺度塊、分區策略)為其他超高分辨率醫學圖像分割樹立了新范式。研究獲臺灣科技部(NSTC 112-2221-E-002-049-MY3)資助,代碼與數據集將開源以促進領域發展。

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