16p11.2 神經精神拷貝數變異誘導神經元中轉錄組和表觀基因組的細胞類型特異性全局重編程研究

《European Journal of Human Genetics》:Cell-type specific global reprogramming of the transcriptome and epigenome in induced neurons with the 16p11.2 neuropsychiatric CNVs

【字體: 時間:2025年05月16日 來源:European Journal of Human Genetics 3.7

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  為探究 16p11.2 拷貝數變異(CNVs)相關神經精神疾病機制,研究人員利用誘導多能干細胞(iPSC)至誘導神經元(iN)模型,分析患者與對照的基因表達和 DNA 甲基化。發現轉錄組和甲基化組全局重編程,鑒定出 PCSK9 及原鈣粘蛋白(PCDH)家族等關鍵靶點,為相關疾病研究提供資源。

  
人類基因組 16p11.2 位點的拷貝數變異(CNVs,包括缺失或重復)已知會增加自閉癥譜系障礙(ASD)、精神分裂癥及其他多種發育性疾病的風險。本研究利用從 16p11.2 CNV 患者和對照中獲得的誘導多能干細胞(iPSC)向誘導神經元(iN)分化的細胞模型系統,探究其對基因表達和 DNA 甲基化的全局影響。該方法揭示了基因組范圍和細胞類型特異性的基因表達及 DNA 甲基化模式改變,并提出了可能導致 16p11.2 患者某些表型的特定基因線索。研究發現轉錄組和 DNA 甲基化組均發生全局重編程,觀察到全基因組范圍內差異表達基因集和差異甲基化區域集,且在缺失和重復基因型之間具有共享性且變化方向一致; PCSK9 被確定為可能促成 16p11.2 CNV 攜帶者所見癥狀的因素,原鈣粘蛋白(PCDH)基因家族在 CNV 患者樣本中被發現具有改變的 DNA 甲基化模式。本研究中使用的 iPSC 細胞系可通過資源庫獲取,為研究 16p11.2 CNV 臨床表型的分子病因以及一般神經精神和神經發育障礙的分子病因提供資源。

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