帕金森病患者癡呆風險預測:基因與共病因素的關鍵作用

《npj Parkinson's Disease》:Predicting dementia in people with Parkinson’s disease

【字體: 時間:2025年05月14日 來源:npj Parkinson's Disease 6.7

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  帕金森。≒D)患者認知障礙問題突出,近半會在確診 10 年內發展為癡呆(PDD) 。研究人員利用機器學習和多模態數據,探究 PDD 預測性及風險因素。結果發現遺傳易感性和共病影響大,高血壓、2 型糖尿病與 PDD 有關。該研究為預防 PDD 提供方向。

  帕金森。≒arkinson’s disease,PD)是一種常見的神經退行性疾病,近年來其發病率不斷攀升,給患者、家屬以及醫療系統都帶來了沉重的負擔。PD 患者除了會出現運動癥狀,如運動遲緩(bradykinesia)、靜止性震顫(tremor at rest)和肌強直(rigidity)外,認知障礙問題也十分突出。大約 25% 的 PD 患者會出現輕度認知障礙,45% 的患者在確診后的 10 年內會發展為帕金森病癡呆(Parkinson’s disease dementia,PDD)。PDD 不僅會增加醫療支出,還會嚴重降低患者的生活質量,甚至標志著疾病進入終末期。然而,目前對于為何部分 PD 患者會更早出現認知障礙,以及如何預測這種疾病進展,科學界仍知之甚少。此前的研究雖然發現了一些與 PD 認知障礙相關的遺傳風險變異,但這些研究多基于特定隊列,數據缺乏代表性,相關模型在臨床實踐中的應用也存在困難。因此,迫切需要開展新的研究,利用更常規收集的健康數據,探索影響 PDD 的因素,為預防和干預提供依據。
為了解決這些問題,來自德國弗勞恩霍夫算法與科學計算研究所(Fraunhofer Institute for Algorithms and Scientific Computing,SCAI)等多個研究機構的研究人員展開了深入研究 。他們的研究成果發表在《npj Parkinson's Disease》上。該研究利用英國生物銀行(UK Biobank,UKB)的大規模數據,結合帕金森進展標記倡議(Parkinson’s Progression Markers Initiative,PPMI)隊列數據進行驗證,旨在預測 PD 患者的癡呆風險,并探究可改變的風險因素,為預防策略提供參考。這一研究對于深入了解 PDD 的發病機制、制定有效的預防措施具有重要意義,有望為 PD 患者及其家庭帶來新的希望。

研究人員主要運用了以下關鍵技術方法:

  • 機器學習模型構建:構建了懲罰邏輯回歸、隨機森林(Random Forests)和 XGBoost 三種模型,通過五重嵌套交叉驗證預測 PDD,評估模型性能。
  • 特征分析:利用可解釋人工智能(Explainable AI,XAI)技術中的 Shapley 加性解釋(Shapley Additive Explanation,SHAP)分析,確定影響模型預測的重要特征,并計算不同數據模態的累積影響。
  • 關系分析:通過貝葉斯網絡(Bayesian networks,BN)結構學習,分析各變量間的條件統計依賴關系。
  • 因果推斷:運用孟德爾隨機化(Mendelian randomization,MR)分析,確定高血壓、2 型糖尿病等共病與 PDD 之間的潛在因果關系。

研究結果


  1. 患者和對照組的人口統計學特征:在 UKB 數據中,PD 患者以男性居多(61.3%),平均年齡 62.7 歲,PDD 組男性比例更高(69.8%),平均年齡 64.1 歲 。PPMI 數據中,PD 患者男性比例與 UKB 相似(60.4%),平均年齡 61.8 歲,PDD 組男性比例略低于 UKB(61.5%),平均年齡 67.1 歲。
  2. PDD 的可預測性:評估三種模型預測 PDD 的能力,隨機森林和邏輯回歸模型的平均 AUC 為 0.62,XGBoost 為 0.61 。消融研究表明,人口統計學、共病和遺傳因素對模型貢獻最大。使用 PPMI 數據集重復分析,隨機森林模型在 PPMI 上的交叉驗證預測性能更高,平均 AUC 為 0.65±0.02。
  3. SHAP 分析:以隨機森林模型為例,SHAP 分析顯示多基因風險評分 PGS4281 是主要預測因子,隨后是 SNP rs769449、年齡等 。遺傳因素對模型預測的影響最大(49.31%),其次是人口統計學因素(24.32%)和共病因素(15.74%)。在 PPMI 數據集上的分析結果類似。
  4. 預測因子的相互作用:通過 BN 結構學習發現,各數據模態內及不同模態間存在多種關聯,如糖尿病、肥胖與高血壓、高膽固醇血癥相關,年齡影響焦慮、抑郁,性別與多種疾病和行為因素有關,還發現了一些基因位點與非遺傳變量的聯系1。
  5. 孟德爾隨機化確定高血壓對 PDD 的因果影響:MR 分析顯示,高血壓會增加 PDD 風險,2 型糖尿病也可能有影響 。MR-Egger 敏感性分析和 MR-PRESSO 分析進一步驗證了相關結果,確認了高血壓與 PDD 之間的潛在因果關系。

研究結論與討論


該研究首次基于 UKB 人群研究探索 PDD 的可預測性及多種因素的相互作用。雖然模型預測性能目前不適合臨床使用,但有助于患者分層,減少臨床試驗樣本量 。研究表明遺傳因素對 PDD 風險影響最大,共病因素如高血壓、2 型糖尿病等與 PDD 存在潛在因果關系。這提示臨床中對 PD 患者進行血壓和血糖管理,可能是預防 PDD 的重要策略。

不過,研究也存在一定局限性。UKB 數據中 PD 和 PDD 的診斷依賴 ICD 編碼,可能存在誤差;使用基因分型陣列而非全基因組或全外顯子測序,可能遺漏重要遺傳因素;參與者多為英國白人、老年人且男性居多,樣本代表性有限,UKB 中 PD 和 PDD 患者樣本量相對總體疾病人群較小。盡管研究人員利用 PPMI 數據部分解決了這些問題,但仍需進一步研究。

總體而言,該研究創新性地結合多種分析方法,揭示了 PDD 發病機制中遺傳、共病、環境和生活方式因素的復雜相互作用,為后續研究和預防策略制定提供了重要依據,對推動帕金森病領域的研究和臨床實踐發展具有重要意義。

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