法國斗牛犬高級別少突膠質細胞瘤的差異基因表達分析:腫瘤及微環境基因表達的品種特異性差異

《Companion Animal Health and Genetics》:Differential gene expression analysis in French bulldog high grade oligodendroglioma: breed-associated differences in tumor and tumor microenvironment gene expression

【字體: 時間:2025年05月10日 來源:Companion Animal Health and Genetics

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  本研究針對法國斗牛犬高級別少突膠質細胞瘤(HGO)對免疫治療反應差的問題,通過RNA測序技術對比其與拳師犬、波士頓梗的腫瘤轉錄組差異。研究發現31個差異表達基因(DEGs)及15條富集通路(如E2F靶點、mTOR信號等),揭示了品種特異性分子特征與免疫治療響應差異的潛在關聯,為犬類神經腫瘤精準治療及人類膠質瘤模型優化提供新依據。

  

研究背景與意義
高級別少突膠質細胞瘤(HGO)是犬類最常見的原發性腦腫瘤,法國斗牛犬、拳師犬和波士頓梗作為同系品種雖共享高發病率,但法國斗牛犬接受免疫治療后生存期(132天)顯著短于其他品種(221天)。這一臨床差異暗示腫瘤生物學可能存在品種特異性,但此前研究未系統探索基因表達層面的差異。明尼蘇達大學的研究團隊在《Companion Animal Health and Genetics》發表論文,首次通過轉錄組學揭示法國斗牛犬HGO的獨特分子特征,為優化免疫治療策略提供科學依據。

關鍵技術方法
研究團隊對18例犬HGO樣本(11例法國斗牛犬,7例對照品種)進行RNA測序(RNASeq),采用DESeq2分析差異基因,通過基因集富集分析(GSEA)鑒定關鍵通路。所有樣本來自福爾馬林固定石蠟包埋(FFPE)組織,經質量控制(RIN>2)和標準化處理,測序深度達40M reads/樣本。

研究結果

差異基因表達特征
法國斗牛犬HGO中鑒定出31個蛋白編碼差異基因(DEGs),其中14個上調(如FGF4、DLA88、HSP90AB1),17個下調(如PNKP、BRAT1)。FGF4表達量最高(log2FC=6.44),可能與法國斗牛犬特有的FGF4逆轉錄基因相關;MHC I類分子DLA88的上調提示免疫逃逸機制激活。

通路富集分析
15條富集通路可歸為三類:

  1. 細胞周期調控:E2F靶點、G2-M檢查點通路激活,驅動腫瘤增殖;
  2. 致癌信號:KRAS、mTOR和Myc靶點通路富集,促進惡性進展;
  3. 免疫調節:干擾素響應、補體通路及TNF-α/NF-κB信號異常,解釋免疫治療抵抗。

討論與意義
該研究首次證實犬HGO存在品種特異性轉錄組特征。法國斗牛犬中FGF4和DLA88的異常表達可能源于遺傳背景,而免疫相關通路(如Allograft rejection)的富集與其臨床預后差直接相關。這些發現不僅為犬類精準醫療提供靶點(如抑制HSP90AB1或mTOR通路),還提示人類膠質瘤研究中需考慮遺傳背景對治療響應的影響。未來需擴大樣本驗證DLA88等位基因的品種分布,并探索FGF4在腫瘤發生中的直接作用。

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