卡內基 9 期（CS9）胚胎處于原腸胚形成結束、早期器官發生開始的關鍵階段，對主要器官系統發育的啟動至關重要。借助空間轉錄組學技術，研究人員對完整的 CS9 人類胚胎展開了細致入微的空間分析。通過觀察 75 個橫向冷凍切片，他們數字化重構出 3D 模型，成功識別出多種細胞類型，涵蓋腦和脊柱區域、原始腸管、不同體節形成階段、體壁中胚層、臟壁中胚層等。值得一提的是，研究發現后腦發育存在兩條截然不同的軌跡，還精準定位了中腦 - 后腦邊界的峽部組織者，描繪出神經中胚層祖細胞（NMP）的雙層結構，闡述了早期主動脈的形成過程，以及在主動脈 - 性腺 - 中腎（AGM）區域發現了原始生殖細胞（PGCs）的蹤跡 。這項研究為深入理解塑造人體藍圖的轉錄組和空間復雜性提供了關鍵線索。