單細胞染色體與批量轉錄組分析:鑒別局限性與轉移性嗜鉻細胞瘤及交感神經副神經節瘤的診斷新利器
《Oncogene》:Single-cell chromosome and bulk transcriptome analysis as a diagnostic tool to differentiate between localized and metastatic pheochromocytoma and sympathetic paraganglioma
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時間:2025年05月04日
來源:Oncogene 6.9
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目前,約 10 - 20% 的嗜鉻細胞瘤或交感神經副神經節瘤(PPGL)患者會發展為轉移性疾病,但缺乏初診時預測其生物學行為的精準生物標志物。研究人員開展相關研究,發現二者基因組景觀相似但轉錄存在差異,這有助于初診時患者分層。
摘要:大約 10 - 20% 的嗜鉻細胞瘤(pheochromocytoma)或交感神經副神經節瘤(sympathetic paraganglioma,PPGL)患者會發生轉移性疾病,大多表現為異時性病變。遺憾的是,目前缺乏能夠在初次診斷時預測 PPGL 生物學行為的精確生物標志物。研究人員對患有 PPGL 且被診斷為局限性或轉移性疾。òㄍ瑫r性或異時性轉移)的患者的腫瘤樣本進行研究,通過應用單細胞全基因組測序(single-cell whole-genome sequencing)和批量轉錄組分析(bulk transcriptome analysis,包括對 RNA 序列的變異檢測分析),開展了全面的分子分析。研究發現,PPGL 呈現出復雜的核型,存在反復出現的非整倍體現象,并且細胞間核型差異顯著,這表明局限性和轉移性腫瘤中都存在持續的染色體不穩定性(chromosomal instability,CIN)。另一方面,轉錄組分析揭示了局限性和轉移性 PPGL 之間的一些差異,轉移性 PPGL 中的 TNFα和 TGFβ信號通路在最初看似未發生轉移、但后來發生異時性轉移的 PPGL 原發性腫瘤樣本中就已可檢測到?傮w而言,研究結果表明,雖然局限性和轉移性 PPGL 一般具有相似的基因組景觀,但它們在轉移發生前的原發性腫瘤 PPGL 中就已表現出可檢測到的轉錄差異。這一發現可能為改善初次診斷時的患者分層提供重要工具。
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