美國斯坦福大學的伯納德·金及其同事在7月18日出版的開放獲取期刊《公共科學圖書館·生物學》上報告說，大量新的基因組序列數據填補了果蠅生命之樹的主要空白。

果蠅是生物學研究中的經典模式生物，也是首批完成全基因組測序的物種之一。果蠅有超過4400個物種，果蠅家族的多樣性可以提供對進化模式和過程的見解。但這些物種中只有一小部分完成了基因組測序，而大多數已發表的果蠅基因組序列都是來自一組非常有限的物種，具有代表性的近親繁殖實驗室菌株。

為了解決這個問題，研究人員對果蠅科179種果蠅的基因組進行了測序，包括野生捕獲的果蠅、保存在博物館的標本和實驗室飼養的菌株。使用混合測序方法，結合了最新的短讀和長讀測序技術，他們能夠從有限的材料中產生低成本，高質量的基因組序列。他們利用新的基因組序列和先前發表的數據，為果蠅科的360個物種制作了一棵系統發育樹，完善了我們對這些物種進化關系的理解。他們還對近300個果蠅基因組進行了比對，作為未來比較基因組研究的開源工具，比如全基因組比對。

雖然對哺乳動物等大型生物的大規模測序工作正在順利進行，但這項研究表明，對蒼蠅等小型生物的基因組測序——甚至是那些在博物館里保存了20年的生物——現在是可能的。

作者補充說:“現在考慮為數百或數千個物種組裝基因組是完全可行的，甚至在一個實驗室的研究預算上也是如此。這種大規模的、進化枝水平的采樣將為我們研究果蠅等不同群體的基因組序列提供前所未有的分辨率，這肯定會提高我們對進化過程的理解�！�